在少年三国志的后期阶段，资源管理成为显著挑战，玩家经常面临决定因素材料如宝物精炼石和高阶装备材料的严重短缺，这些资源的日常产出无法满足激增的消耗需求。资源分配需要高度精细化，玩家必须优先将有限的金币、元宝和道具投入到核心武将培养上，避免分散投资造成浪费。稳定获取资源的途径如限时活动主题和副本挑战必须积极参和，但资源获取效率下降往往让玩家感到力不从心，容易陷入成长停滞的困境。

游戏后期的方法深度出现明显不足，主要依赖重复刷副本和单调的资源积累，容易陷入战力数值的比拼循环。阵型组合方面，流派选择空间被压缩，策略性相比前期减弱，玩家也许发现固定的阵型组合难以应对多样化的战斗场景。战斗机制缺乏持续创造的内容，长期尝试中新鲜感容易流失，影响玩家的投入积极性。

社交互动和团队协作在后期存在明显缺口，除了基本的军团战和竞技场外，大型团队方法缺乏深度策略配合。多人副本更注重数值检验而非战略协同，难以激发玩家的长期参和感。跨服方法虽然提供了竞争平台，但奖励机制和匹配制度也许让普通玩家失去追赶动力，削弱了社交互动的吸引力。

养成体系在后期遇到瓶颈，红将和金装获取后，提高空间主要集中在数值微调上。法宝、神兵等子体系虽然丰盛了培养维度，但后期解开内容大多是对已有功能的重复扩展，缺乏能改变战斗逻辑的深度养成要素。活动主题设计偏给短期消耗，节日活动主题以限时任务为主，奖励集中在资源补给，缺乏长期目标或创造玩法来维持玩家参和度。